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Une application Web gratuite de visualisation 3D des molécules

La rédaction

Bionext, société de bio-informatique lance BiovizJS, son application Web gratuite de visualisation en 3D des structures moléculaires. L'étude des propriétés structurelles et des interactions physico-chimiques est essentielle pour comprendre les mécanismes biomoléculaires. BiovizJS peut être déployée et exécutée sur n'importe quel périphérique, fixe ou mobile, et offre un rendu 3D optimisé pour les principaux navigateurs Web. L'application propose le même niveau de fonctionnalité que les outils natifs de visualisation moléculaire. Fournie avec une API simple et claire, BiovizJS peut être facilement et rapidement déployée sur le site Web de l'utilisateur, ou testée directement depuis la plateforme. L'application supporte ainsi les formats PDB et PDBX/mmCIF, et propose les représentations moléculaires les plus communes (en bâtons, en surfaces...), des cartographies en couleurs (CPK, hydrophobie...) ainsi qu'un système de qualification des propriétés. Un outil de mesure permet en outre d'afficher les interactions potentielles entre chaque chaîne d'une même structure. BiovizJS offre également une modularité exceptionnelle visant à améliorer l'expérience de l'utilisateur avec des techniques de rendu 3D avancées, basées sur les effets WebGL et un contrôle utilisateur multimodal, compatible avec les souris standard, les souris 3D et les écrans tactiles. Ce dernier point rend l'application utilisable sur n'importe quel terminal fixe ou mobile, y compris les smartphones et les tablettes. L'application bénéficie par ailleurs de scripts permettant d'animer les molécules et de donner vie à des présentations scientifiques. Un outil d'export d'images, avec un arrière-plan transparent pour en faciliter l'intégration dans les publications et communications scientifiques est également disponible. BiovizJS est actuellement utilisée sur BioSight, la plateforme Web de bio-simulation de Bionext, destinée à accélérer l'identification des effets potentiels d'un candidat-médicament sur le corps humain, ainsi que par neXtprot, une plateforme de découverte basée sur des données relatives aux protéines.

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